。一伙来自中亚的恐怖组织在香港秘密扎根，短短几年，他们在香港地区根深叶茂，火速发展起来。
新世纪之初，来自香港的问题接连不断，街头骚乱致使伤亡事件频发，大火烧毁了一栋又一栋笼屋，大量的贫民流离失所。滚滚的浓烟背后，每起事件都笼罩着恐怖组织的阴影。香港地理位置特殊，政治地位敏感。驻港部队频频受制，来自中国大陆的年轻警察秦湛经过了全国选拔，临危受命，只身潜入香港，他不惧生命危险，以过人的胆识和魄力一次次闯过了敌人设下的陷阱，运用军方的高科技武器阻止了敌人一次又一次的犯罪阴谋。
在香港暂居的四个月，秦湛化身大陆来港的打工仔“阿云”，寄住在一处隐蔽的笼屋中。他的邻居多是些靠领救济金生活的阿公阿婆，对初来乍到的“阿云”从排斥到接纳，慢慢的，又到照顾。“阿云”受伤是阿婆的女儿亲手帮他包扎，“阿云”夜里回家没得饭吃，隔壁阿公放在窗边的碗里给他专门留了一口。
终于有一日，恐怖分子的眼线发现了秦湛的藏身之处，熊熊大火将这片笼屋彻底消灭。火光冲天，贫民们伤亡惨重，秦湛背着阿婆逃出笼屋，他身份,bao露，收到上级指令，必须紧急离港。秦湛却不能忍受“亲人们”受他的连累，遭此劫难。他将受伤的“亲人”救助出来，忍着悲痛，深夜出击，驾驶一辆残缺不全的报废车辆穿越重重火线，像一匹孤狼，单刀直入恐怖分子的地下基地。
影片结尾，维多利亚港平静的海面骤然掀起一阵惊涛骇浪，位于海面下的犯罪分子基地在连番爆炸声中轰然瓦解。就在香港警察组织人力，沿着港口深入搜查的时候。一块浮木将伤痕累累生死未卜的秦湛托了起来，在南海海面越飘越远。
“狼烟四起，有敌来犯。”这句秦湛无数次收到的任务指令，也成为了《狼烟》所有版本海报上的统一标语。影片前期以快速的镜头描绘出香港的社会动乱，小警察秦湛在警察局不受上司的重视，怀才不遇，在全国公安内部选拔中拼死夺得了第一。初来香港，秦湛又因为语言不通，闹出不少笑话，每次任务都是运气刚刚好，他急中生智，才得以惊险过关。他来自大陆，免不得受些阿公阿婆们的偏见，可秦湛为人善良，家中亲人早亡，他便将这些老人当作自己的亲人来对待。真心换得真心，丁望中拍惯了杀人枪战戏码，用心描绘其中这些穿插的小桥段，更让观众的心紧紧揪在秦湛的身上。
止于暧昧的爱情戏份发生在“阿云”和邻居阿婆的女儿家慧之间。家慧是个普通港女，刚刚察觉到“阿云”的双重身份，他们的家就被彻底烧毁了，而“阿云”就此消失，像他们
